MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 38670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
2	NC_017279	AAACGA	2	12	42	53	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384447321
3	NC_017279	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	384447321
4	NC_017279	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	384447321
5	NC_017279	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
6	NC_017279	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
7	NC_017279	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447321
8	NC_017279	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447321
9	NC_017279	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447321
10	NC_017279	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
11	NC_017279	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
12	NC_017279	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447321
13	NC_017279	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447321
14	NC_017279	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
15	NC_017279	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
16	NC_017279	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
17	NC_017279	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447321
18	NC_017279	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447321
19	NC_017279	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
20	NC_017279	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447321
21	NC_017279	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	384447321
22	NC_017279	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
23	NC_017279	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	384447321
24	NC_017279	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447321
25	NC_017279	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	384447321
26	NC_017279	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	384447321
27	NC_017279	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447321
28	NC_017279	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447321
29	NC_017279	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017279	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017279	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017279	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017279	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017279	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017279	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017279	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
37	NC_017279	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
38	NC_017279	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	384447322
39	NC_017279	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447322
40	NC_017279	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447322
41	NC_017279	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	384447322
42	NC_017279	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
43	NC_017279	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384447322
44	NC_017279	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447322
45	NC_017279	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447322
46	NC_017279	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447322
47	NC_017279	TTAT	2	8	1768	1775	25 %	75 %	0 %	0 %	384447322
48	NC_017279	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
49	NC_017279	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
50	NC_017279	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447322
51	NC_017279	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447322
52	NC_017279	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
53	NC_017279	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447322
54	NC_017279	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
55	NC_017279	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	384447322
56	NC_017279	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
57	NC_017279	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	384447322
58	NC_017279	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447322
59	NC_017279	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447322
60	NC_017279	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447322
61	NC_017279	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447322
62	NC_017279	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	384447323
63	NC_017279	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
64	NC_017279	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
65	NC_017279	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	384447323
66	NC_017279	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	384447323
67	NC_017279	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447323
68	NC_017279	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	384447323
69	NC_017279	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
70	NC_017279	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	384447323
71	NC_017279	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
72	NC_017279	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447323
73	NC_017279	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447323
74	NC_017279	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	384447323
75	NC_017279	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
76	NC_017279	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
77	NC_017279	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	384447323
78	NC_017279	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	384447323
79	NC_017279	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447323
80	NC_017279	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447323
81	NC_017279	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	384447323
82	NC_017279	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	384447323
83	NC_017279	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447323
84	NC_017279	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447323
85	NC_017279	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
86	NC_017279	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384447323
87	NC_017279	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384447323
88	NC_017279	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
89	NC_017279	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
90	NC_017279	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384447323
91	NC_017279	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384447323
92	NC_017279	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
93	NC_017279	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447323
94	NC_017279	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	384447323
95	NC_017279	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384447323
96	NC_017279	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
97	NC_017279	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	384447323
98	NC_017279	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	384447323
99	NC_017279	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447323
100	NC_017279	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
101	NC_017279	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
102	NC_017279	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
103	NC_017279	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
104	NC_017279	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	384447323
105	NC_017279	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
106	NC_017279	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
107	NC_017279	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447323
108	NC_017279	GAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017279	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447324
110	NC_017279	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	384447324
111	NC_017279	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447324
112	NC_017279	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447324
113	NC_017279	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	384447324
114	NC_017279	CATC	2	8	5057	5064	25 %	25 %	0 %	50 %	384447324
115	NC_017279	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447324
116	NC_017279	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	384447324
117	NC_017279	AATC	2	8	5171	5178	50 %	25 %	0 %	25 %	384447324
118	NC_017279	T	7	7	5248	5254	0 %	100 %	0 %	0 %	384447324
119	NC_017279	GCAT	2	8	5287	5294	25 %	25 %	25 %	25 %	384447325
120	NC_017279	AT	3	6	5300	5305	50 %	50 %	0 %	0 %	384447325
121	NC_017279	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384447325
122	NC_017279	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447325
123	NC_017279	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447325
124	NC_017279	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	384447325
125	NC_017279	T	6	6	5694	5699	0 %	100 %	0 %	0 %	384447325
126	NC_017279	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447325
127	NC_017279	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384447325
128	NC_017279	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	384447325
129	NC_017279	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384447325
130	NC_017279	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447325
131	NC_017279	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447325
132	NC_017279	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447325
133	NC_017279	T	6	6	6119	6124	0 %	100 %	0 %	0 %	384447325
134	NC_017279	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447325
135	NC_017279	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	384447325
136	NC_017279	TCTT	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	384447325
137	NC_017279	TGG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447325
138	NC_017279	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447325
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